سخنگوی دولت با مصوبه روز سه شنبه مجلس در زمینه لغو پروتکل الحاقی مخالفت کرد و گفت: قطعا شورای نگهبان در مورد این طرح به این موارد توجه خواهد کرد و به محدودیتهای قانونی، ملاحظات و مصلحت های ملی توجه خواهد شد. به نظر دولت، موضوع از اختیارات شورای عالی امنیت ملی است.